ان-هگزان خالص در آزمایشگاه ها مورد استفاده قرار می گیرد، در صنایع دارویی و شیمیایی کاربرد دارد. ان-هگزان بیشتر در صنایع با ترکیبات شیمیایی مشابه خود که حلال های آلی می باشند مورد استفاده قرار گرفته و استفاده اصلی آن به عنوان حلال برای استخراج روغن گیاهی از دانه هایی شبیه سویا است. این حلال ها همچنین به عنوان عامل های پاک کننده در صنایع چاپ، منسوجات، آرایشی و تزئینی مورد استفاده می باشد. برخی از چسب های خاص که در پوشش های بام ساختمان و یا در صنایع کفش و چرم به کار می روند، همچنین چسب های سریع العمل و محصولات مصرفی مانند بنزین و اسباب بازی ها دارای ان-هگزان می باشند.